MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 1466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011986	GTC	2	6	54181	54186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1002	NC_011986	TTC	2	6	54199	54204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102387
1003	NC_011986	TCGT	2	8	54211	54218	0 %	50 %	25 %	25 %	222102387
1004	NC_011986	GCC	2	6	54296	54301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102387
1005	NC_011986	CGT	2	6	54369	54374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1006	NC_011986	GGC	2	6	54475	54480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1007	NC_011986	TCG	2	6	54500	54505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1008	NC_011986	CGAGTT	2	12	54609	54620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222102387
1009	NC_011986	GCG	2	6	54744	54749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1010	NC_011986	GGCGAG	2	12	54769	54780	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222102387
1011	NC_011986	GGC	2	6	54855	54860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1012	NC_011986	GAG	2	6	54961	54966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102387
1013	NC_011986	GC	3	6	55016	55021	0 %	0 %	50 %	50 %	222102387
1014	NC_011986	ATC	2	6	55030	55035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102387
1015	NC_011986	TGCG	2	8	55073	55080	0 %	25 %	50 %	25 %	222102387
1016	NC_011986	ATCGCC	2	12	55117	55128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222102387
1017	NC_011986	GAT	2	6	55137	55142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102387
1018	NC_011986	GCG	2	6	55231	55236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1019	NC_011986	TTC	2	6	55258	55263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102387
1020	NC_011986	CTG	2	6	55267	55272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1021	NC_011986	ATC	2	6	55273	55278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102387
1022	NC_011986	AGG	2	6	55316	55321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102387
1023	NC_011986	GCC	2	6	55322	55327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102387
1024	NC_011986	GGC	3	9	55365	55373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1025	NC_011986	CTG	2	6	55378	55383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1026	NC_011986	TGA	2	6	55406	55411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102387
1027	NC_011986	CTG	2	6	55465	55470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1028	NC_011986	GGC	2	6	55530	55535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1029	NC_011986	CGA	2	6	55602	55607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1030	NC_011986	ATC	2	6	55690	55695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102387
1031	NC_011986	GC	4	8	55737	55744	0 %	0 %	50 %	50 %	222102387
1032	NC_011986	ATC	2	6	55786	55791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102387
1033	NC_011986	CGG	2	6	56064	56069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1034	NC_011986	CAT	2	6	56082	56087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102387
1035	NC_011986	CGA	2	6	56127	56132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1036	NC_011986	CGGTA	2	10	56289	56298	20 %	20 %	40 %	20 %	222102387
1037	NC_011986	CGA	2	6	56339	56344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1038	NC_011986	TCG	2	6	56384	56389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1039	NC_011986	GCA	2	6	56443	56448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1040	NC_011986	TGA	2	6	56525	56530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102387
1041	NC_011986	TCG	2	6	56531	56536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1042	NC_011986	CTG	2	6	56563	56568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1043	NC_011986	CGG	2	6	56637	56642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1044	NC_011986	GAT	2	6	56649	56654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102387
1045	NC_011986	GTG	2	6	56655	56660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102387
1046	NC_011986	CGCT	2	8	56705	56712	0 %	25 %	25 %	50 %	222102387
1047	NC_011986	ATCT	2	8	56746	56753	25 %	50 %	0 %	25 %	222102387
1048	NC_011986	GAT	2	6	56868	56873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102387
1049	NC_011986	CGT	2	6	56877	56882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102387
1050	NC_011986	TGCCG	2	10	56952	56961	0 %	20 %	40 %	40 %	222102387
1051	NC_011986	CGG	2	6	56967	56972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102387
1052	NC_011986	CCG	2	6	57011	57016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102387
1053	NC_011986	GC	3	6	57052	57057	0 %	0 %	50 %	50 %	222102387
1054	NC_011986	AGA	2	6	57123	57128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102388
1055	NC_011986	GCT	2	6	57229	57234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102388
1056	NC_011986	GAC	2	6	57294	57299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102388
1057	NC_011986	TAC	2	6	57372	57377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102388
1058	NC_011986	G	6	6	57482	57487	0 %	0 %	100 %	0 %	222102388
1059	NC_011986	CGT	2	6	57499	57504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102388
1060	NC_011986	ACG	2	6	57505	57510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102388
1061	NC_011986	GGTCA	2	10	57554	57563	20 %	20 %	40 %	20 %	222102388
1062	NC_011986	AT	3	6	57597	57602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011986	GCA	2	6	57621	57626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011986	CGC	3	9	57629	57637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_011986	GCC	2	6	57638	57643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_011986	TCGG	2	8	57757	57764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_011986	TCA	2	6	57775	57780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011986	GGTTCG	2	12	57870	57881	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222102389
1069	NC_011986	CGTC	2	8	57910	57917	0 %	25 %	25 %	50 %	222102389
1070	NC_011986	GCC	2	6	57971	57976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102389
1071	NC_011986	ACC	2	6	58043	58048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102389
1072	NC_011986	GCCGC	2	10	58102	58111	0 %	0 %	40 %	60 %	222102389
1073	NC_011986	GATC	2	8	58149	58156	25 %	25 %	25 %	25 %	222102389
1074	NC_011986	CGG	2	6	58217	58222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102389
1075	NC_011986	GCG	2	6	58237	58242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102389
1076	NC_011986	AGC	2	6	58271	58276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102389
1077	NC_011986	CAG	2	6	58285	58290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102389
1078	NC_011986	AGCGCG	2	12	58304	58315	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222102389
1079	NC_011986	TGCA	2	8	58343	58350	25 %	25 %	25 %	25 %	222102389
1080	NC_011986	GCCCT	2	10	58351	58360	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1081	NC_011986	GCG	2	6	58371	58376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_011986	CGC	2	6	58427	58432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_011986	CGC	2	6	58492	58497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_011986	CCG	2	6	58515	58520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102390
1085	NC_011986	T	6	6	58531	58536	0 %	100 %	0 %	0 %	222102390
1086	NC_011986	GAT	2	6	58755	58760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102390
1087	NC_011986	CAAGC	2	10	58774	58783	40 %	0 %	20 %	40 %	222102390
1088	NC_011986	GTC	2	6	58852	58857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102390
1089	NC_011986	GTT	2	6	58947	58952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102390
1090	NC_011986	GCG	2	6	59168	59173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011986	CGC	2	6	59176	59181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_011986	AAT	2	6	59188	59193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011986	GGC	2	6	59334	59339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011986	ATC	2	6	59358	59363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102391
1095	NC_011986	CAG	2	6	59383	59388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102391
1096	NC_011986	CGAAC	2	10	59428	59437	40 %	0 %	20 %	40 %	222102391
1097	NC_011986	AG	3	6	59456	59461	50 %	0 %	50 %	0 %	222102391
1098	NC_011986	CA	3	6	59469	59474	50 %	0 %	0 %	50 %	222102391
1099	NC_011986	CAAT	2	8	59543	59550	50 %	25 %	0 %	25 %	222102391
1100	NC_011986	CGC	2	6	59564	59569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102391
1101	NC_011986	GGC	2	6	59577	59582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102391
1102	NC_011986	CGC	2	6	59594	59599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102391
1103	NC_011986	ATC	2	6	59610	59615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102391
1104	NC_011986	TCC	2	6	59634	59639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102391
1105	NC_011986	GAA	2	6	59641	59646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102391
1106	NC_011986	TGCT	2	8	59689	59696	0 %	50 %	25 %	25 %	222102391
1107	NC_011986	CT	3	6	59722	59727	0 %	50 %	0 %	50 %	222102391
1108	NC_011986	A	6	6	59740	59745	100 %	0 %	0 %	0 %	222102391
1109	NC_011986	TCCT	2	8	59757	59764	0 %	50 %	0 %	50 %	222102391
1110	NC_011986	CGC	2	6	59790	59795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_011986	GC	3	6	59798	59803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_011986	CGGG	2	8	59824	59831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_011986	CT	3	6	59863	59868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_011986	GCT	2	6	59872	59877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011986	CG	3	6	59879	59884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_011986	CG	3	6	60029	60034	0 %	0 %	50 %	50 %	222102392
1117	NC_011986	GGT	2	6	60083	60088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102392
1118	NC_011986	CCA	2	6	60101	60106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102392
1119	NC_011986	CGC	2	6	60257	60262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102392
1120	NC_011986	GAC	2	6	60320	60325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102392
1121	NC_011986	GAA	2	6	60410	60415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102392
1122	NC_011986	TTC	2	6	60434	60439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_011986	GCC	2	6	60449	60454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_011986	CGC	2	6	60487	60492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_011986	GAT	2	6	60733	60738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102393
1126	NC_011986	CGCC	2	8	60796	60803	0 %	0 %	25 %	75 %	222102393
1127	NC_011986	CGC	2	6	60814	60819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102393
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1258	NC_011986	GGCG	2	8	68418	68425	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1259	NC_011986	CG	3	6	68424	68429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1260	NC_011986	GGCT	2	8	68486	68493	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1261	NC_011986	GCG	2	6	68526	68531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_011986	CGG	2	6	68546	68551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_011986	CAT	2	6	68592	68597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1265	NC_011986	CAT	2	6	68835	68840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1272	NC_011986	T	7	7	69252	69258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_011986	ATAC	2	8	69259	69266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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